新中国成立初期,原震旦大学同学会解散。在台湾的震旦大学校友后于台北市杭州南路成立震旦校友会,并兴建"震旦中心"大楼(现为天主教震旦外语中心),以示纪念。
1985年6月,上海第二医学院更名为上海第二医科大学;同年6月9日,震旦大学校友会于上海第二医科大学成立,会址重庆南路280号。1992年经上海市民政批准,成立上海震旦大学校友会(2004年因校友们年事已高而注销改为震旦校友联络中心)。2005年7月,上海第二医科大学与上海交通大学合并组建新的上海交通大学,更名为上海交通大学医学院,仍使用重庆南路227号和280号之校区。